1、如果你是贷的学校的款，毕业前未还清，学校会扣留你的毕业证和学位证，直到你把贷款还清，才允许你重新办一边离校手续，把证书发给你；

2、如果你是贷的银行的款，毕业前未还清，要看你当时和银行签的协议，以协议为准；如果当时贷款只和银行签的没有经过学校且贷款已经交到学校交学费了，那么对学校来说已经收到你的钱了，不会扣留你的毕业证和学位证；如果当时贷款时是和学校、银行三方签的协议，并且协议里约定没还清款学校有义务协助催款，并且催款方式是扣证的话，那么学校会扣证的；

3、如果你办理了生源地助学贷款，大部分地方都是不给现金直接扣学费的，那么学校不会扣你的毕业证和学位证，因为钱已经到账上来了。特殊情况如果你办的生源地助学贷款是直接把钱打你卡上，你没有给学校财务交的，那学校会扣留你的毕业证和学位证了。 总之一句话，学校扣不扣证，就看你学费交清了没有，只要你不欠学校的钱就不会扣。

既然你的贷款合同上写明的是“毕业后三年开始还款”，毕业的时候就不要求还清贷款，也就没有扣留毕业证和学位证之说了。一般现在助学贷款有明文规定了，双方签订了还款的合同，就按照合同履行就可以了，没有必要担心。