一、针对对象不同

省公积金中心一般针对企事业单位或省内达到省管级别机关的内职工；市公积金一般针对容城镇私营企业及其他社会团体等普通企业职工。

二、运用范围不同

省公积金可以在全省内使用，运用范围较广；而市公积金只能在市内使用，运用范围较狭窄。

三、组合贷款还款方式不同

使用组合贷款买房的，如果申请了省公积金贷款，可以先还商业贷款部分，再还公积金贷款部分；而使用市公积金贷款的则需按一定比例同时偿还，不过具体政策应以当地住房公积金中心规定为准。

四、使用条件限制不同

有些省在首套房上，省市公积金贷款都一样，但在第二套住房上，省公积金是按房子来看的，第二套房用公积金首付50%；而市公积金是按使用公积金的次数来看的，如第一套住房没有用公积金，那第二套住房公积金贷款是按首套住房来算，即首付30%。