第三套住房不可以申请公积金贷款。公积金只为用户购买第一套住房以及第二套住房发放贷款，至于第三套住房用户只可以申请商业贷款。商业贷款与公积金贷款相比，贷款利率高、贷款额度高，但是贷款次数不受任何限制。公积金贷款，只允许用户最多申请两次贷款。

第三套住房申请商业贷款，并不会影响用户之前的房贷。之前的两套房产，不管是全款买的，还是贷款买的，第三套房都不允许申请公积金贷款。由于公积金贷款具有利率低的优势，因此用户贷款买房时，建议优先申请公积金贷款，贷款额度不足可以申请组合贷款。

不符合公积金贷款条件，又想申请房贷，则用户可以申请商业贷款，商业贷款的申请条件与公积金申请条件是不同的。