公积金贷款还款是可以大于缴存额的。公积金贷款额度是根据公积金余额、公积金缴纳时间以及公积金月度缴存额度综合计算的，因此公积金贷款月度还款额度和公积金贷款总额以及贷款年限有关于月度缴存额并没有直接的关系，缴存额不足月度还款时需要自行从普通账户补缴即可。