合同编号的作用主要便于归档和查询。合同编号一般由合同拟定方确定，无所谓甲乙。如果双方都坚持由自己拟定合同，只有一方选择让步，否则合同无法签署。

法律依据：《民法典》 第四百七十条 合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：

(一)当事人的姓名或者名称和住所;

(二)标的;

(三)数量;

(四)质量;

(五)价款或者报酬;

(六)履行期限、地点和方式;

(七)违约责任;

(八)解决争议的方法。

合同编号防止员工私用合同

合同编号是为了便于保存和查找。